В составе центра работают отделения:
- консультативная поликлиника
- эндоскопическое
- функциональной и ультразвуковой диагностики
- лучевой диагностики
- клинико-диагностическая лаборатория
- сурдологическое
- медико-генетическая консультация
- лечебно-диагностическое
- центр пароксизмальных состояний
- лаборатория клинической патоморфологии
- медицинской реабилитации
- кафедра ВГМУ